сборка эталонного генома
Содержание
исчезающего трехцветного черного дрозда, Agelaius tricolor | Журнал наследственности
Журнальная статья
Принятая рукопись
Кимберли М. Баллэр,
Кимберли М Баллэр
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Мерли Эскалона,
Мерли Эскалона
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Келли Барр,
Келли Барр
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Уильям Селигманн,
Уильям Селигманн
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Самуэль Сакко,
Самуэль Сакко
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Рута Мадхусудан Сахасрабудхе,
Рута Мадхусудан Сахасрабудхе
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Оанх Нгуен,
Оан Нгуен
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Кристи Вайкофф,
Кристи Вайкофф
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Томас Б. Смит,
Томас Б. Смит
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Бет Шапиро
Бет Шапиро
Ищите другие работы этого автора на:
Оксфордский академический
пабмед
Google ученый
Примечания автора
Журнал наследственности , esac053, https://doi.org/10.1093/jhered/esac053
Опубликовано:
13 сентября 2022 г.
История статьи
Получено:
21 июля 2022 г.
Опубликовано:
13 сентября 2022 г.
Фильтр поиска панели навигации
Journal of HeredityGenetics and GenomicsBooksJournalsOxford Academic
Термин поиска мобильного микросайта
Закрыть
Фильтр поиска панели навигации
Journal of HeredityGenetics and GenomicsBooksJournalsOxford Academic
Термин поиска на микросайте
Advanced Search
Abstract
Трехцветный дрозд, Agelaius tricolor, — это стадный вид, который образует огромные колонии для размножения и поиска пищи в заболоченных и сельскохозяйственных местах обитания, в основном в Калифорнии, США. Когда-то чрезвычайно многочисленная, численность видов резко сократилась за последнее столетие, в основном из-за утраты мест размножения и кормодобывания. Трехцветные дрозды в настоящее время занесены в список МСОП как находящиеся под угрозой исчезновения и находящиеся под угрозой исчезновения в соответствии с Законом Калифорнии об исчезающих видах. Требуется больше генетической информации, чтобы детализировать эволюционные последствия узкого места в масштабах всего вида и информировать об управлении сохранением. Здесь мы представляем непрерывный эталонный геном трехцветного черного дрозда, собранный с помощью длинных ридов PacBio HiFi и данных Omni-C «ласточкин хвост» для создания сборки на уровне каркаса, содержащей каркасы с несколькими длинами хромосом. Этот геном добавляет ценный ресурс для важных эволюционных и природоохранных исследований трехцветных дроздов и родственных видов.
California Conservation Genomics Project, CCGP, длинная сборка, полный геном, Icteridae, черные дрозды Нового Света
Принятые рукописи
Принятые рукописи представляют собой версии окончательной авторской рукописи в формате PDF, принятые для публикации журналом, но до редактирования или верстка. Их можно цитировать, используя автора (авторов), название статьи, название журнала, год онлайн-публикации и DOI. Они будут заменены окончательными набранными статьями, которые, следовательно, могут содержать изменения. DOI останется неизменным.
Этот контент доступен только в формате PDF.
Примечания автора
K.M.B. и ME в равной степени внесли свой вклад в эту работу. Первые авторы могут отдавать приоритет своим именам при указании этой ссылки в своих резюме.
© Американская генетическая ассоциация. 2022.
Это статья с открытым доступом, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/), которая разрешает неограниченное повторное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе, при условии, что оригинальная работа правильно процитирована.
© Американская генетическая ассоциация. 2022.
Раздел выпуска:
Геномные ресурсы
Скачать все слайды
Дополнительные данные
Дополнительные данные.0002 Реклама
Цитаты
Альтметрика
Дополнительная информация о метриках
Оповещения по электронной почте
Оповещение об активности статьи
Предварительные уведомления о статьях
Оповещение о новой проблеме
Оповещение о теме
Получайте эксклюзивные предложения и обновления от Oxford Academic
Ссылки на статьи по номеру
Последний
Самые читаемые
Самые цитируемые
Эталонный геном колючей обезьяны, Cebidichthys violaceus
Высококачественная сборка генома лаосской сельди (Tenualosa thibaudeui), эндемичного вида бассейна реки Меконг
Эталонный геном на уровне хромосом универсальной сказочной креветки, Branchinecta lindahli
.
Проект эталонного генома креветки Vernal Pool Fairy Shrimp, Branchinecta lynchi
.
Проект эталонного генома красного морского ушка, Haliotis rufescens, для сохранения геномики
Реклама
Политика конфиденциальности — Триколор Инк
Компания Триколор стремится защищать вашу конфиденциальность и разрабатывать технологии, обеспечивающие вам максимально эффективную и безопасную работу в Интернете. Это Положение о конфиденциальности применяется к веб-сайту Триколор и регулирует сбор и использование данных. Используя веб-сайт Триколор, вы соглашаетесь с методами работы с данными, описанными в этом заявлении.
Сбор вашей личной информации
Триколор собирает личную информацию, такую как ваш адрес электронной почты, имя, домашний или рабочий адрес или номер телефона. Триколор также собирает анонимную демографическую информацию, которая не является уникальной для вас, например, ваш почтовый индекс, возраст, пол, предпочтения, интересы и избранное.
Это также информация о ваших компьютерных аппаратных средствах и программном обеспечении, которая автоматически собрана Триколор. Эта информация может включать: ваш IP-адрес, тип браузера, доменные имена, время доступа и адреса веб-сайтов, на которые вы ссылаетесь. Эта информация используется Триколор для работы сервиса, поддержания качества обслуживания, а также предоставления общей статистики использования веб-сайта Триколор.
Имейте в виду, что если вы напрямую раскрываете личную информацию или личные конфиденциальные данные через общедоступные доски объявлений Триколор, эта информация может быть собрана и использована другими лицами. Примечание. «Триколор» не читает ваши личные онлайн-сообщения.
«Триколор» рекомендует вам ознакомиться с заявлениями о конфиденциальности веб-сайтов, на которые вы переходите по ссылке с «Триколор», чтобы вы могли понять, как эти веб-сайты собирают, используют и передают вашу информацию. Триколор не несет ответственности за заявления о конфиденциальности или другой контент на веб-сайтах, не входящих в Триколор и семейство веб-сайтов Триколор.
Использование вашей личной информации
Триколор собирает и использует вашу личную информацию для работы веб-сайта Триколор и предоставления запрошенных вами услуг. Триколор также использует вашу личную информацию для информирования вас о других продуктах или услугах, доступных от Триколор и его аффилированных лиц. Триколор также может связываться с вами с помощью опросов для изучения вашего мнения о текущих услугах или о потенциальных новых услугах, которые могут быть предложены.
Триколор не продает, не сдает в аренду и не сдает в аренду свои списки клиентов третьим лицам. Триколор может время от времени связываться с вами от имени внешних деловых партнеров по конкретному предложению, которое может вас заинтересовать. В этих случаях ваша уникальная личная информация (электронная почта, имя, адрес, номер телефона) не передается третьей стороне. Кроме того, Триколор может передавать данные доверенным партнерам, чтобы помочь нам провести статистический анализ, отправить вам электронное или обычное письмо, обеспечить поддержку клиентов или организовать доставку. Всем таким третьим лицам запрещено использовать вашу личную информацию, кроме как для оказания этих услуг для Триколор, и они обязаны поддерживать конфиденциальность вашей информации.
Триколор не использует и не раскрывает конфиденциальную личную информацию, такую как расовая, религиозная или политическая принадлежность, без вашего явного согласия.
Триколор отслеживает сайты и страницы, которые посещают наши клиенты в рамках Триколор, чтобы определить, какие услуги Триколор являются наиболее популярными. Эти данные используются для предоставления персонализированного контента и рекламы в Триколоре клиентам, поведение которых указывает на то, что они интересуются определенной тематикой.
Веб-сайты Триколор будут раскрывать вашу личную информацию без предварительного уведомления, только если это требуется по закону или добросовестно полагая, что такие действия необходимы для: (а) соблюдения указов закона или выполнения судебного процесса. на Триколоре или сайте; (б) защищать и защищать права или собственность Триколора; и (c) действовать в неотложных обстоятельствах для защиты личной безопасности пользователей Триколора или общественности.
Использование файлов cookie
Веб-сайт Триколор использует файлы cookie, чтобы помочь вам персонализировать работу в Интернете. Файл cookie — это текстовый файл, который размещается на вашем жестком диске сервером веб-страницы. Файлы cookie нельзя использовать для запуска программ или доставки вирусов на ваш компьютер. Файлы cookie присваиваются только вам и могут быть прочитаны только веб-сервером в домене, который выдал вам файл cookie.
Одной из основных целей файлов cookie является предоставление функции удобства для экономии вашего времени. Цель файла cookie — сообщить веб-серверу, что вы вернулись на определенную страницу. Например, если вы персонализируете страницы Триколор или регистрируетесь на сайте или в сервисах Триколор, файл cookie помогает Триколору вспомнить вашу конкретную информацию при последующих посещениях. Это упрощает процесс записи вашей личной информации, такой как платежные адреса, адреса доставки и т. д. Когда вы возвращаетесь на тот же веб-сайт Триколор, ранее предоставленная вами информация может быть восстановлена, поэтому вы можете легко использовать настроенные вами функции Триколор.
У вас есть возможность принять или отклонить файлы cookie. Большинство веб-браузеров автоматически принимают файлы cookie, но обычно вы можете изменить настройки своего браузера, чтобы отказаться от файлов cookie, если хотите. Если вы решите отказаться от файлов cookie, возможно, вы не сможете в полной мере использовать интерактивные функции сервисов Триколор или веб-сайтов, которые вы посещаете.
Безопасность вашей личной информации
Триколор защищает вашу личную информацию от несанкционированного доступа, использования или раскрытия. Триколор обеспечивает сохранность личной информации, которую вы предоставляете, на компьютерных серверах в контролируемой, безопасной среде, защищенной от несанкционированного доступа, использования или раскрытия. Когда личная информация (например, номер кредитной карты) передается на другие веб-сайты, она защищается с помощью шифрования, такого как протокол Secure Socket Layer (SSL).
Изменения к этому заявлению
Триколор будет время от времени обновлять это заявление о конфиденциальности, чтобы отразить отзывы компании и клиентов.